مدیرعامل شرکت فرودگاه‌ها درحالی از‌ سوی وزیر راه با حفظ سمت، سرپرست سازمان هواپیمایی شده است که یکی از اصلی‌‌ترین وظایف سازمان هواپیمایی، «نظارت بر عملکرد فرودگاه‌ها» و « تأیید ‌صلاحیت فنی و تخصصی مدیران و مسئولان عملیاتی فرودگاه‌ها» است.