به گفته بسیاری از افراد نزدیک به آیت الله بهجت(ره)، ایشان در طول حیات خود با مقام معظم رهبری ارتباطی دوستانه و گاه جلسات خصوصی با ایشان داشت.

شرط استجابت دعا، ترک معصیت است... گاهی مصلحت، در غیر تعجیل است و گاهی مصلحت، در تبدیل به احسن است. داعی خیال می کند مستجاب نشده است و اهل یقین می فهمند.

امام زمان (عج) از اینکه در قضای حاجت [مؤمن] و نجات او از بلا سعی کند ممنوع نیست. الی ماشاالله دیده شده که شیعه را در وقتی که راه دیگری نبوده، نجات داده‌اند.

آیت‌الله بهجت می‌فرمود: خدا می‌داند قرآن برای اهل ایمان مخصوصاً اگر اهل علم باشند چه معجزه‌ها و کراماتی دارد و چه چیزهایی از آن خواهند دید.

از ایت الله بروجردی خواسته بودند بر جنازه رضاخان نماز بخواند. ولی ایشان فرموده بود: «مگر می‌شود با آن همه پرده‌دری که در کشف حجاب کرد بر او نماز خواند؟»

زمان شیوع طاعون در سامرا، شیعیان به زیارت عاشورا متوسل شدند. درنتیجه فوج فوج از غیرشیعه در اثر طاعون وفات کردند ولی یک نفر شیعه به این بیماری وفات نکرد.